两税合一是许多人的期待，它有利于促进内外资企业在同一税收制度平台下展开公平竞争，有利于促进民族企业提高自主创新能力；可以正确引导外资投资方向，促使我国利用外资从数量向质量转化。同时，两税合一也有利于提升我国上市公司收益。据有关人士估计，两税合一对我国A股市场全部公司的净利润，有6%－8%的提升幅度，中小投资者的股东权益将因此增加。因而，具有非常积极的意义。

　　但同时也应该认识到，税率仅仅是导致内外资企业税负不平等的一个因素，除此之外，还有一个重要因素，即优惠因素。只有这两个问题都“合一”了，两税才能真正做到统一。

　　长期以来，外资企业所得到的税收优惠大大优于内资企业。内资企业的优惠力度较小，范围较窄，优惠政策主要集中在社会福利、劳动就业、贫困地区扶植等方面。而对外资企业的优惠力度很大，范围很宽，优惠政策主要偏重于吸引直接投资、鼓励出口、使用先进技术等。在所得税纳税扣除方面，外资企业也比内资企业更为宽松，税前扣除项目、标准、范围的差异很大。外资企业还可因投资行业、经营期限、投资数额和产品出口比例符合法律要求而分别再享受“五免五减”、“二免三减”、“一免二减”，有的还能享受减按10%的税率征税或者再投资退税等特殊优惠待遇。

　　这种状况还延续到了人才身上。在个人所得税方面，我国规定，凡在中国境内的外商投资企业、外国企业和其他部门工作的外籍人员（包括华侨、港澳同胞）的工资、薪金所得，依照《个人所得税法》的规定应缴纳的个人所得税税额，减半征收。这种状况导致内资企业在人才竞争方面劣于外资企业。

　　同时，一些地方政府为了吸引外资，擅自作主给外资更大更多的优惠，有些优惠政策甚至突破了法律和中央政策的限制。这种优惠政策与税率一起，导致内资企业所得税平均实际负担率为23%左右，外资企业所得税平均实际负担率为11%左右，两者相差一倍左右。

　　内外资税率统一以后，据测算，如果新法在2008年实施，和旧法相比，税率降低加上税前扣除扩大，内资企业所得税将减少1340亿，而外资企业所得税则增加410亿。外资企业一直对两税合一持反对态度。据报道，2005年初，54家跨国公司曾经联合向国务院提交了一份报告，提出暂缓取消对他们的税收优惠政策。税率统一以后，外资企业可能转而向地方政府施压，以获得地方政府更多的优惠政策，继续与内资企业在税负方面“保持距离”，在竞争中占据更加有利的位置。所以，税率统一以后，相关外资企业的压力将逐渐转移到地方政府身上，而地方政府为了留住外资，有可能作出让步，给外资企业更多优惠政策，使“内外有别”的状况继续存在。

　　应该看到，我国现行的税收优惠政策缺乏统一性、规范性和透明度。税法及其细则只对优惠政策作出原则性规定，而具体措施则散见于财政部、国家税务总局发布的各种通知、法规，这导致税收优惠政策缺少规范，自由裁量权和权力寻租的空间过大。也正因为这一点，地方政府继续给予外资超越权限优惠政策的可能性非常大。

　　因此，在内外资税率统一以后，应对税收优惠政策进行全面规范，以刚性的具体规定替代模糊的原则性规定，使内外资企业不仅在税率上平等，在优惠政策方面也应一视同仁，如此，才能真正做到两税合一。