第四十九条　企业之间支付的管理费、企业内营业机构之间支付的租金和特许权使用费，以及非银行企业内营业机构之间支付的利息，不得扣除。
　　「释义」　本条是关于企业发生的一些特殊费用不准扣除的规定。
　　本条的内容是条例新增的规定，原内资、外资税法对此均未作直接规定。本条规定的不得扣除费用包括。
　　一、企业之间支付的管理费
　　原外资税法规定，企业不得列支向其关联企业支付的管理费。本条改变了原外资税法的规定，明确规定，企业无论是接受关联方还是非关联方提供的管理或其他形式的管理服务而发生的管理费，不得扣除。现行市场经营活动中，企业之间的分工日益精细化和专门化、专业化，从节约企业成本角度等考虑，对于企业的特定生产经营活动，委托其他企业或者个人来完成，较之企业自己去完成，可能更为节约，所以就出现了企业之间提供管理或者其他形式的服务这种现象。但是企业之间支付的管理费，既有总分机构之间因总机构提供管理服务而分摊的合理管理费，也有独立法人的母子公司等集团之间提供的管理费。由于企业所得税法采取法人所得税，对总分机构之间因总机构提供管理服务而分摊的合理管理费，通过总分机构自动汇总得到解决。对属于不同独立法人的母子公司之间，确实发生提供管理服务的管理费，应按照独立企业之间公平交易原则确定管理服务的价格，作为企业正常的劳务费用进行税务处理，不得再采用分摊管理费用的方式在税前扣除，以避免重复扣除。
　　二、企业内营业机构之间支付的租金和特许权使用费
　　过去，内资企业基本纳税实体界定上遵循独立核算标准，将企业内部能够独立核算的营业机构或者分支机构作为独立纳税人处理，为准确反映企业不同营业机构的应纳税所得额，对内部提供管理服务、融通资金、调剂资产等内部往来活动一般需要按照独立交易原则处理，分别确认应税收入和费用。企业内部营业机构属于企业的组成部分，不是一个对外独立的实体，根据企业所得税法汇总纳税的规定，它不是一个独立的纳税人，而应由企业总机构统一代表企业来进行汇总纳税。实践中，企业出于管理和生产经营等因素的需要，可能采取相对独立的内部营业机构管理，内部营业机构在企业内部具有相对独立的资产、经营范围等，这就可能使这些内部营业机构之间可能发生类似于独立企业之间进行的所谓融通资金、调剂资产和提供经营管理等服务，但是企业内部营业机构之间进行的这类业务活动，属于内部业务活动，虽然在不同内部营业机构之间，可能也有某种账面记录，也区分不同内部营业机构之间的收入、支出等等，但是在缴纳企业所得税时，由于它们不是独立的纳税人，需由企业汇总纳税，所以对于这些内部业务往来所产生的费用，均不计入收入和作为费用扣除。
　　三、非银行企业内营业机构之间支付的利息
　　与企业内营业机构之间支付的租金和特许权使用费不得扣除的理由类同，非银行企业内营业机构之间的资金拆借行为，本身是同一法人内部的交易行为，其发生的资金流动，不宜作为收入和费用体现；另外，由于企业内各营业机构不是独立的纳税人，而且企业所得税法实行法人所得税，要求同一法人的各分支机构汇总纳税，即取得利息收入的营业机构作为收入，支付利息的营业机构作为费用，汇总纳税时相互抵消，在税前计入收入或者扣除没有实际意义。但是，需要注意的是，这部分不得扣除的费用，不包括银行企业内部营业机构之间支付的利息，这主要考虑到银行企业内部营业机构主要从事的就是资金拆借行为，其成本和费用的支出，主要就体现为利息，如果不允许银行企业内营业机构之间支付的利息扣除，对各银行企业内营业机构的会计账务、业绩等都无法如实准确反映，且由于实行法人汇总纳税后，准许银行企业内营业机构之间支付的利息扣除，相应获取这部分利息的其他银行企业内营业机构就将这部分利息作为收入，两者相抵，并不影响企业的应纳税总额，国家的税收利益不会受到影响。
　　第五十条　非居民企业在中国境内设立的机构、场所，就其中国境外总机构发生的与该机构、场所生产经营有关的费用，能够提供总机构出具的费用汇集范围、定额、分配依据和方法等证明文件，并合理分摊的，准予扣除。
　　「释义」　本条是关于非居民企业总分机构之间有关费用的扣除规定。
　　非居民企业在中国境内设立的机构、场所要取得某种收入，往往需要其在中国境外的总机构提供某种管理或者其他生产经营方面上的支撑服务，有些费用支出可能是通过总机构或者由总机构所负担的，虽然企业所得税法实行的是法人税制，但是根据企业所得税法第三条的规定，在中国境内设立机构、场所的非居民企业在中国只负有限的纳税义务，就其在中国境内所设立的机构、场所获取的来源于中国境内的所得和来源于境外但与所设机构、场所有实际联系的所得纳税，若不允许非居民企业在中国境内所设机构、场所分摊其在中国境外总机构所发生的有关费用，可能会出现这些机构、场所的特定生产经营活动的费用支出无法得以体现，也不符合收入与支出的配比原则，所以原外资税法实施细则规定，外国企业在中国境内设立的机构、场所，向其总机构支付的同本机构、场所生产、经营有关的合理的管理费，应当提供总机构出具的管理费汇集范围、总额、分摊依据和方法的证明文件，并附有注册会计师的查证报告，经当地税务机关审核同意后，准予列支；外商投资企业应当向其分支机构合理分摊与其生产、经营有关的管理费。本条沿袭了原外资税法实施细则的规定，允许非居民企业向其在中国境内设立的机构、场所分摊有关费用，但必须满足以下几个要求。
　　一、所分摊的费用必须是由中国境外总机构所负担，且与其在中国境内设立的机构、场所生产经营有关。即，首先这部分允许分摊的费用，必须是由非居民企业在中国境外的总机构所负担，且这部分费用是与其在中国境内设立的机构、场所的生产经营有关，否则不得作为本条规定的分摊费用。
　　二、在中国境内设立的机构、场所能够提供总机构出具的费用汇集范围、定额、分配依据和方法等证明文件。
　　这主要是考虑到，基于税收管辖权上的局限性以及税务机关征管能力的局限性等，若没有非居民企业在中国境内设立的机构、场所的协助，中国的税务机关可能无法掌握总分机构之间的费用往来情况，所以有必要规定非居民企业在中国境内设立的机构、场所有提供证明文件的义务。
　　三、有关费用必须是合理分摊的，才准予扣除。
　　这是企业所得税税前扣除中收入与支出配比原则基本要求，若存在证据表明总机构分摊给中国境内分支机构的有关费用不合理的，或者通过乱摊费用，以获取某种非法税收利益的，将不允许扣除这些费用。